Ngòi Nhù khởi nguồn từ hợp lưu các sông suối ở xã Sơn Thủy huyện Văn Bàn, chảy uốn lượn theo hướng tây bắc. Đến xã Văn Sơn sông đổi hướng đông bắc và từ đó nước đổ vào sông Hồng.

Nguồn cấp nước chính và chủ yếu của ngòi Nhù là sông Minh Lương, trong đó đoạn chảy ở xã Sơn Thủy có tên là suối Chăn, chảy đến bản Khe Chăn thì đổ vào ngòi Nhù.